Structura Turnului lui Hercule
Declinul Imperiului Roman și comerțul au început declinul marilor rute maritime, astfel încât farul a început un lung proces de abandon, ruină și pradă care a continuat în timpul Evului Mediu Înalt. Deși era foarte probabil să nu se aprindă, turnul a continuat să fie un reper de prim rang pentru navigația de coastă efectuată cu bărci mici, care a devenit relativ intensă în apele interioare, cum ar fi estuarele Galiciei.
În timpul invaziilor normande, în a doua jumătate a secolului al IX-lea, din cauza amenințărilor externe și a scăderii activității comerciale și portuare, nucleul Brigantium a fost practic abandonat de populația sa care s-a mutat într-o așezare mai sigură situată la fundul estuarului. Rămășițele farului au fost folosite ca turn de veghe extrem de defensiv.
La sfârșitul Evului Mediu, teama unei invazii pe mare scade și există o reactivare a comerțului și o repopulare a litoralului. Carta Puebla acordată de Alfonso IX în 1208 presupune întemeierea unui nou oraș. Turnul este încă un turn de veghe și servește drept far maritim.
La sfârșitul aceluiași secol, Alfonso X și-a publicat Istoria Spaniei. Într-unul din pasajele sale, amestecând realitatea, legenda și mitul clasic al lui Hercule, el își plasează confruntarea cu gigantul Geryon în finisarea atlantică. După ce și-a ucis dușmanul, Hercule îl îngropă pe malul mării și construiește un turn-far deasupra mormântului său, pe lângă înființarea orașului Crunia. Din secolul al XIII-lea, farul a păstrat acest nume.
Părțile ruinate ale farului au fost folosite ca carieră de piatră pentru construcțiile orașului până în secolul al XVI-lea, când prădarea lor a fost interzisă. În a doua jumătate a secolului a fost construită o scară interioară din lemn pentru a permite accesul la felinarul farului prin camere, deoarece rampa exterioară dispăruse complet.
Este foarte posibil ca în acest moment să fie pus din nou în funcțiune ca semnal maritim, deoarece traficul maritim prin comerțul dintre Europa și America s-a intensificat, făcând din La Coruña un port strategic pe Atlantic. La sfârșitul secolului al XVII-lea, restaurarea turnului a fost promovată, astfel încât farul să funcționeze din nou continuu. Guvernatorul Regatului Galiciei, Duque de Uceda, i-a însărcinat maestrului Amaro Antúnez să realizeze proiectul de reparații, care a constat în construirea unei noi scări din lemn care să o înlocuiască pe cea realizată în secolul al XVI-lea și care permitea accesul la rotundă a turnului din interiorul clădirii prin intermediul camerelor. Pentru trecerea scării menționate a fost necesară forarea a trei bolți romane. Acest lucru a rezolvat accesul în partea superioară a turnului după pierderea rampei exterioare care dispăruse din cauza trecerii timpului și a jafului continuu al materialelor pentru a fi utilizate în alte construcții.
În aceeași lucrare, două turele încoronate de două felinare au fost construite pe platforma de finisare a clădirii, unde rămășițele rotundei romane erau încă păstrate, farul recuperându-și lumina. Soluția, fiind modestă, nu a fost definitivă și, începând cu 1730, s-a ridicat din nou nevoia de a o reforma complet, realizând diferite rapoarte și proiecte privind starea și reparația acesteia.
În 1788 regele Carlos al III-lea a ordonat restaurarea turnului, efectuată de inginerul militar Eustaquio Giannini, asistat de José Cornide. La acea vreme, clădirea păstra doar din lucrarea romană structura patrulateră internă a camerelor și vechea rotundă superioară care fusese renovată în secolul al XVII-lea. Proiectul a constat în întreținerea și consolidarea generală a corpului prismatic principal, la care s-a adăugat o căptușeală de piatră pe cele patru fațade ale sale care ascundeau zidurile romane sub acest anvelopă. În acest fel, sub un aspect reînnoit, structura originală a fost menținută și datorită acestui fapt, a fost păstrată până astăzi. Intervenția respectă ruina romană, apreciind-o ca o mărturie unică a ingineriei antice. Această admirație pentru ceea ce a fost construit l-a determinat să marcheze intervenția sa, introducând mici pietre negre care funcționează ca martori la restaurare, făcând posibilă identificarea punctelor în care structura originală a fost modificată.
Proiectul a păstrat în exterior memoria amintei vechii rampe care în vremurile străvechi permitea ascensiunea către felinar prin asigurarea unei benzi elicoidale ascendente care se întinde de-a lungul fațadelor sale; și a construit noul finisaj, în așa fel încât stâlpii octogonali ai așa-numitei camere Giannini marchează perimetrul rotundei romane.
Fațadele constau dintr-un soclu inferior și patru muluri netede în colțuri. În ceea ce privește deschiderile, a proiectat o pereche de ferestre cu huse de praf care sunt distribuite pe cele patru fațade și le-a deschis doar pe cele care corespund nișelor preexistente, restul sunt orbi.
În interior, proiectul a respectat configurația celor patru camere boltite suprapuse pe trei niveluri ale construcției romane. Nevoia de a face urcarea până la felinar confortabilă și funcțională a forțat bolțile să fie găurite pentru a face loc unei scări mai confortabile din piatră, înlocuind-o pe cea construită pe vremea ducelui de Uceda. Sensul giratoriu roman care s-a păstrat încă, deși a fost mult modificat, a fost demolat pentru a moderniza sistemul de semnalizare al farului. Neputând profita de structura existentă, a fost proiectată o nouă compoziție nouă, bazată pe suprapunerea a două corpuri octogonale. Finalizate lucrările, cele două plăci de bronz care comemorează restaurarea farului au fost așezate pe ușile de acces la Turn.