Compoziția acizilor grași omega-3 din fileurile de somon din Atlantic; Global Aquaculture Advocate
Studiul de asociere a genomului identifică variante genetice
Somonul Atlantic (Salmo salar) este o specie importantă de pește de crescătorie, cunoscută pentru conținutul său ridicat în mușchi de acizi grași polinesaturați omega-3 cu lanț lung (omega-3 LC PUFA) care promovează sănătatea, acidul eicosapentaenoic (EPA; 20: 5 omega-3) și acid docosahexaenoic (DHA; 22: 6 omega-3). Nivelurile de PUFA omega-3 LC au scăzut semnificativ în ultimele decenii datorită înlocuirii unei porțiuni mari de ingrediente marine cu ingrediente vegetale mai durabile în dieta somonului de Atlantic cultivat. Analizele genetice cantitative au estimat parametrii genetici ai acizilor grași omega-3 ai somonului Atlantic și au arătat potențialul reproducerii selective pentru a crește nivelurile de omega-3 LC PUFA în fileurile de somon, deoarece acestea sunt trăsături ereditare.
Mai multe studii au observat o depunere selectivă mai mare de DHA în mușchi comparativ cu alți acizi grași din dietă. EPA, pe de altă parte, pare a fi metabolizat într-o măsură mai mare decât DHA în mușchi. Un studiu recent al somonului Atlantic realizat de grupul nostru a constatat că conținutul de EPA muscular a fost asociat negativ cu expresia genelor implicate în catabolismul lipidic și a emis ipoteza că diferențele individuale în conținutul de EPA sunt cauzate de oxidarea selectivă a acizilor grași (FA). Cu toate acestea, există cunoștințe limitate despre ce gene și căi metabolice sunt cele mai importante în determinarea conținutului de EPA și DHA în mușchiul somonului Atlantic.
Studiile de asociere la nivel de genom (GWAS) sunt un instrument puternic care poate identifica polimorfismele cu nucleotide unice [SNP - o substituție a unei singure nucleotide (elementele de bază ale ADN-ului și ARN-ului) care sunt produse într-o poziție specifică a genomului (set complet de ADN din orice organism)] legat de gene asociate cu trăsături fenotipice (observabile). S-au efectuat GWAS ale compoziției FA musculare la bovine și porcine, unde au fost identificate mai multe regiuni și loci asociați semnificativ. La pești, un studiu efectuat pe șobolan asiatic (sau barramundi, Lates calcarifer) a arătat complexitatea arhitecturii genetice a FA la pești.
Pentru a crește înțelegerea geneticii conținutului de PUFA în omega-3 LC muscular în somonul Atlantic, GWAS este o abordare relevantă care nu a fost încă explorată în somonul Atlantic. Acest articol, adaptat și rezumat din post original [Horn S.S. și colab. 2020. GWAS identifică variantele genetice asociate cu compoziția de acizi grași omega-3 a fileurilor de somon din Atlantic.] - rapoarte despre un studiu pentru identificarea variantelor genetice asociate cu conținutul de acizi grași omega-3 cu lanț lung din mușchiul somonului Atlantic, prin efectuarea unui studiu de asociere la nivel de genom (GWAS).
Configurarea studiului
Un total de 642 de pești de la 92 de bărbați și 194 de femele au fost incluși în analiză. Toți masculii aveau patru sau mai mulți descendenți de la mai multe femele. Peștele provine dintr-o populație de reproducere [dintr-o clasă de an] de somon atlantic din SalmoBreed AS. Peștii au fost transferați în mare cu o greutate medie de 0,1 kg și au fost sacrificați aproximativ 12 luni mai târziu, cu o greutate medie de 3,6 kg (cu un interval de 1,2 până la 6,4 kg). Peștii au fost hrăniți cu hrană comercială. Skretting conținând 70% ulei de pește și 3,1% EPA și DHA.
Toți peștii au fost crescuți în aceleași condiții și au fost posti timp de 13 până la 14 zile înainte de sacrificare. După sacrificiu, sexul a fost determinat vizual prin inspecția gonadelor, s-a înregistrat greutatea corporală și s-au prelevat probe de mușchi scheletic pentru analiza lipidelor și FA din Norwegian Quality Cut; probele au fost colectate, congelate și depozitate la -20 grade C pentru diverse analize. Pentru informații detaliate despre populația și înregistrările de pești, analiza grăsimii musculare și a acizilor grași, genotipurile și analiza statistică, vă rugăm să consultați publicația originală. Această lucrare a fost susținută de Consiliul norvegian de cercetare (numărul de subvenție NFR 244200).
Rezultate si discutii
În acest studiu, GWAS a fost efectuat pe 642 de somon de dimensiuni sacrificate din Atlantic, prezentând variații ale conținutului de EPA și DHA. Au fost analizate mai multe trăsături, iar cele mai multe trăsături nu au prezentat valori de probabilitate semnificative (valori p) pentru întregul genom. Excepțiile au fost raportul DHA/ALA [acid α-linolenic] și raportul DHA/DPA [acid docosapentaenoic]. Prin urmare, ne-am concentrat pe aceste două trăsături, pe lângă principalele PUFA-uri omega-3 LC: DHA și EPA.