Recunoașterea selectivă a senzorului operator în regulatorii de răspuns la metalele monovalente în

Text completat

(1) FACULTATEA DE ȘTIINȚE BIOCHIMICE ȘI FARMACEUTICE UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO. Institutul de Biologie Moleculară și Celulară din Rosario. Teză de doctorat în științe biologice. Recunoașterea selectivă a senzorului/operatorului în regulatoarele de răspuns metalice monovalente din Salmonella enterica. Prezentat de: Lic. María Victoria Humbert Director: Dr. Fernando C. Soncini. Rosario, Argentina 2014.

selectivă

(2) 1. Recunoașterea selectivă a senzorului/operatorului în regulatoarele de răspuns metalice monovalente din Salmonella enterica. María Victoria Humbert Licențiată în biotehnologie Facultatea de Științe Biochimice și Farmaceutice Universitatea Națională din Rosario. Această teză este prezentată ca parte a cerințelor pentru calificarea la diploma academică de doctor în științe biologice, de la Universitatea Națională din Rosario și nu a fost prezentată anterior pentru a obține o altă diplomă la această sau la o altă universitate. Conține rezultatele obținute în cercetările efectuate la Institutul de Biologie Moleculară și Celulară din Rosario (IBR-CONICET), zona Biologie moleculară a microorganismelor patogene, dependentă de Facultatea de Științe Biochimice și Farmaceutice, în perioada cuprinsă între 04 iunie 2009 și 27 martie 2014, sub îndrumarea doctorului Fernando C. Soncini.

(3) 2. Familia și prietenii mei.

(6) Index. ABREVIERI DE INDICE. 10. INTRODUCERE. 13. 1. Genul Salmonella 1.1. Ciclul infecțios cu Salmonella și supraviețuirea în mediu. 14 15. 2. Genul Escherichia. 16. 3. Salmonella enterica și Escherichia coli ca modele de studiu. 17. 4. Regulatoare transcripționale. 18. 4.1. Familia MerR de regulatori transcripționali. 18. 4.2. Structura autorităților de reglementare din familia MerR. 19. 4.2.1 Domeniul HTH: un numitor comun în regulatorii de transcripție 4.3. Regulatorii MerR și interacțiunea lor cu ADN-ul. 20 23. 4.3.1 Regulatori tip MerR: paradigmă clasică a reglementării transcripționale 4.3.2 Regulatori MerR neconvenționali. 23 26. 4.3.2.1 Regulatoare CarA/CarS. 28. 4.3.2.2 Regulatoare LitR. 31. 4.3.2.3 Regulatoare MlrA. 32. 4.3.2.4 Regulatoare BluR. 37. 4.3.2.5 Regulatoare Hsp_2. 37. 5. Metale: esențiale, neesențiale și toxice. 38. 5.1. Clasificarea metalelor. 38. 5.2. Strategii de homeostazie/rezistență la metalele de tranziție. 39. 6. Homeostazia cuprului 6.1. 6.2. Homeostazia cuprului în E. coli. 40 41. 6.1.1 Regulamentul tacului. 42. 6.1.2 Regulon cus. 43. 6.1.3 Sistemul alternativ de rezistență la cupru PcoABCD. 44. Homeostazia de cupru în Salmonella 6.2.1 Regulonul tacului. 45 45. 5.

(10) Index. 2.1. Nivelurile ridicate de STM1266 scad motilitatea. 149. 2.2. Expresia excesivă a STM1266 stimulează formarea de biofilme. 150. 2.3. Inducerea STM1266 crește producția și secreția. 2.4. de celuloză. 152. Nivelurile ridicate de STM1266 conferă rezistență la streptomicină. 153. 3. STM1266 și implicația sa în reglarea formării biofilmului. 155. Discuție. 158. 1. Analiza comparativă a reglării transcripționale a csgD la E. coli și S. enterica. 159. 2. Proteine ​​cu domenii GGDEF: reglare pozitivă a csgD. 164. 3. Proteine ​​cu domenii EAL: reglare negativă a csgD. 166. CONCLUZII GENERALE. 168. REZUMAT. 174. REFERINȚE BIBLIOGRAFICE. 176. 9.

(11) Abrevieri. Abrevieri A. Amperi. Abs. Absorbanta ADN. Acidul dezoxiribonucleic. AHL. N-acil-homoserină lactonă. Amp. Ampicilina. ARN. Acid ribonucleic. ARNPol. ARN polimeraza. ATP. Adenozină 5 'trifosfat. BCIP. 5-brom, 4-clor, 3-indofosfat. BSA. Albumină serică bovină. Cbl. Cobalamină. c-di-GMP. bis- (3 '; 5') -guanozin monofosfat ciclic. Cf. Concentrația finală. Ci. Curie. CIM. Concentrație minimă inhibitoare. Cm. Cloramfenicol. C-terminal. Carboxil-terminal. DGC. Diguanylate cyclase. DNază I. Deoxiribonuclează I. DTT. Ditiotreitol. CE. Escherichia coli. EGTA. Etilen glicol bis (β-aminoetil eter) acid N, N, N ', N'-tetraacetic. EMSA. Test de întârziere a mobilității electroforetice. Strep. Streptomicină. Fw. Direct. 10.

(12) Abrevieri g. Gram. g/l. Gramele pe litru. HPLC. Cromatografie lichidă de înaltă presiune. HTH. Helix-turn-helix. IPTG. Izopropil β-D-tiogalactopiranozidă. kA. Constanta de echilibru (asociere). kb. Kilobase. kD. Constanta de echilibru (disociere). Km. Kanamicină. LIVRE. Luria Bertani. NB. Bulion de nutrienți. NBT. Albastru nitrotetrazoliu. nt. Nucleotidă N-terminal. Amino-terminal. ONPG. O-nitrofenil-galactopiranozidă. ORF. Deschideți cadrul de citire. p. Plasmid. P. Promotor. pb. Perechi de baze. PCR. Reacție în lanț a polimerazei. PDE. Fosfodiesterază. (p) ppGpp. Pentafosfat de guanozină. p/v. Greutate în volum. r. Anizotropie fluorescentă. A. Rezistent. RMN. Rezonanță magnetică nucleară. rpm. Rotaţii pe minut. unsprezece.