Adaptarea dietei la câine reflectă răspândirea agriculturii preistorice - ereditate

adaptarea

  • Subiecte
  • rezumat
  • Introducere
  • Materiale și metode
  • Mostre
  • Extragerea ADN-ului
  • Numărul copiei eseului
  • Originea geografică a câinilor.
  • Analiza CNV regională
  • Rezultate
  • Variație general AMY2B în lup, șacal de aur, coiot și câine
  • Distribuția numărului de copii la câini este corelată cu răspândirea agriculturii preistorice
  • Câini nativi
  • Câini europeni
  • Discuţie
  • copiați numerele de AMY2B înmulțit cu cinci în timpul domesticirii câinilor
  • extinderea numărului de copii AMY2B este corelează cu răspândirea agriculturii preistorice
  • Fișier de date
  • Informatie suplimentara
  • Fișiere imagine
  • Figura suplimentară 1
  • Figura 2 suplimentară
  • Fișiere Excel
  • Tabel suplimentar 1
  • Tabelul suplimentar 2
  • Tabelul suplimentar 3
  • Documente Word
  • Legende suplimentare

Subiecte

  • Creșterea animalelor
  • Genetica evolutivă

rezumat

Introducere

Dacă dieta câinilor s-a schimbat în timpul revoluției neolitice, este puțin probabil ca aceasta să aibă legătură cu domesticirea inițială, deoarece acest proces a început probabil (11.000-40.000 YBP) înainte de dezvoltarea agriculturii (10.000-12.000 YBP) (Freedman și colab. Al., 2014). În mod similar, deși o modificare anterioară a dietei ar fi în concordanță cu o perioadă pre-agricolă de domesticire a câinilor, lipsa extinderii numărului de copii AMY2B la dingo-urile australiene și câțiva câini arctici sugerează, de asemenea, că modificarea dietei nu ar fi fost asociată cu domesticirea inițială, dar mai degrabă legată de o schimbare ulterioară a existenței umane (Arendt și colab., 2014; Freedman și colab., 2014).

Pentru a crește înțelegerea modului în care schimbarea dietei câinelui este legată de procesul de domesticire și schimbările de subzistență umană, am realizat primul studiu global al AMY2B CNV utilizând metode precise și fiabile de cuantificare a ADN-ului. Prin acest mijloc obținem prima imagine detaliată a extinderii numărului de copii AMY2B care ne permite să studiem adaptarea amidonului de câine la scară regională și în lumina strategiilor alternative de subzistență umană.

Materiale și metode

Mostre

Pentru a permite analiza detaliată a distribuției numerelor de copii AMY2B pe întreaga populație de câini, am colectat probe de tamponare orală sau de sânge de la 221 de câini, dintre care 95 reprezintă câini nativi din întreaga lume, inclusiv 25 de dingo australieni. câini de rasă. Am inclus, de asemenea, 171 de câini (inclusiv 19 câini nativi din Groenlanda) care au fost anterior genotipați pentru numerele de copii AMY2B (Arendt și colab., 2014) folosind aceeași metodă utilizată în acest studiu. În total, 392 de câini reprezentând 96 de rase diverse și câini nativi au fost analizați în acest studiu (Tabelul suplimentar 1). Pentru a analiza originea extinderii numărului de copii AMY2B am analizat, de asemenea, probe de țesut sau sânge de la 5 șacali de aur bulgari, 1 coiot (din Minnesota) și un total de 51 de lupi, din Africa (n = 1), Croația (9), Estonia (8), Israel (4), Suedia (1), Danemarca (1) și Statele Unite (12) și 15 lupi din populația zoologică suedeză, originari din populațiile naturale de lupi din regiunea baltică (Suedia, Finlanda, Estonia, Letonia și Rusia) (Tabelul suplimentar 2).

Extragerea ADN-ului

ADN-ul a fost extras din sângele EDTA folosind extracția manuală a sării sau kitul QIASymphony DNA Midi (Qiagen, Venlo, Olanda) pe robotul QIASymphony (Qiagen). ADN-ul a fost extras din țesutul muscular folosind trusa DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Probele de frotiu bucal au fost depozitate pe carduri FTA din care ADN-ul a fost ulterior eluat folosind o metodă de fierbere, după cum urmează: mai întâi, 2-3 puncții ale fiecărui card FTA au fost plasate într-un tub și spălate de trei ori în 180 pl de ddH20; în al doilea rând, eluarea a fost efectuată prin adăugarea a 25 μl de ddH20 la fiecare probă și fierberea aceasta timp de 30 de minute la 95 ° C.

Numărul copiei eseului

Originea geografică a câinilor.

Originea a 114 persoane care reprezintă câini nativi (denumiți „nativi” în tabelul suplimentar 1) a fost stabilită la locul de prelevare. Acești câini au fost colectați din regiunile rurale cu un mic aflux de câini străini pe motiv că câinii existenți reprezintă probabil populațiile originale. Câinilor de rasă pură li s-a atribuit originea geografică conform Federation Cynologique International (//www.fci.be) (Tabelul suplimentar 1), cu următoarele excepții: în primul rând, trei câini de rasă pură eșantionați în Japonia (Kawakami-Dog, Ryukyu și Satsuma-Dog), una în Kirgizstan (Afghan Hound) și una în Rusia (Stepnaya) nu au fost recunoscute de Federația Cinologică Internațională, dar au primit totuși țara de origine pe baza statutului lor local bine stabilit; În al doilea rând, American Staffordshire Terriers, Nova Scotia Duck-Tolling Retrievers și Australian Terriers au fost clasificați ca europeni având în vedere originea lor recentă în societăți fondate de coloniști europeni din America de Nord și, respectiv, Australia.